劳动合同纠纷是劳动关系双方因劳动合同的履行而产生的争议。处理劳动合同纠纷程序如下：
一、内部协商
当事人协商解决争议，达成和解协议。
二、劳动争议调解
向劳动保障行政部门申请调解，调解不成，出具调解书。
三、劳动仲裁
向劳动仲裁委员会提起仲裁，仲裁作出裁决，裁决生效后当事人应当履行。
四、劳动诉讼
对仲裁裁决不服，可以向人民法院提起诉讼。
五、执行
按照判决或者裁决执行，不能协商执行的，可申请法院强制执行。
详细处理流程
1、内部协商
当事人双方可以协商解决争议，达成和解协议。和解协议对双方都有约束力，当事人应当履行。
2、劳动争议调解
当事人可以向劳动保障行政部门申请调解。调解员会主持双方进行调解，调解达成协议的，出具调解书。调解书对双方都有约束力，当事人应当履行。
3、劳动仲裁
对调解不服的，可以向劳动仲裁委员会提起仲裁。仲裁委员会会组成仲裁庭进行仲裁，并作出裁决。裁决对双方都有约束力，当事人应当履行。
4、劳动诉讼
对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。人民法院会组成合议庭进行审理，并作出判决。判决对双方都有约束力，当事人应当履行。
5、执行
按照判决或者裁决执行，不能协商执行的，可申请法院强制执行。
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